Kot vsaka različica pred tem, Pokemon Crystal Version bo kmalu na voljo za nakup v e-trgovini Nintendo 3DS.
Nintendo je to napovedal Crystal Version bo prišel v 3DS 26. januarja 2017 in bo imel ceno 9,99 USD. V igro bodo dodane tudi dodatne funkcije.
Natančneje, Crystal bo združljiv z banko Pokemon, kar omogoča igralcem, da prenesejo vse, kar ujamejo v novejše naslove, kot je Ultra Sonce in Ultra Moon. Prav tako bo omogočil navzkrižno bitko in trgovanje s starejšimi različicami, kot je rdeča, Modra, in Rumena, s funkcijo Time Capsule.
Po končani igri bodo igralci imeli možnost zajeti Celebi skozi dogodek v igri. To je v nasprotju z izvirnikom Pokemon Crystal, ki je zahtevala posebno opremo, imenovano Game Shark, da bi prevarala vašo pot do tega redkega Pokemon.
Nintendo tudi navaja, da s sprostitvijo Pokemon Crystal, zdaj bo mogoče prenašati Pokemon od vseh 29 jedrnih iger v seriji Ultra Sonce in Ultra Moon.